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Les recherches pluridisciplinaires développées dans SAPS s’appuient sur des socles de connaissances fondamentales dans 4 grands domaines que sont :

⚙ la génétique, la génomique et l’épigénétique animale ;

⚙ la biologie de la reproduction, du développement et la différenciation cellulaire ;

⚙ la santé animale et humaine ; Immunologie, infectiologie, virologie ;

⚙ la biologie computationnelle associant la modélisation mathématique, la programmation informatique, les statistiques et l’intelligence artificielle.

Les recherches sur les mécanismes fondamentaux du vivant et les grandes fonctions du règne animal ainsi que l’analyse des données qui y sont associées sont regroupées en deux axes transversaux :

• Axe 1 : Organisation fonctionnelle et régulation de l’expression du génome.
• Axe 2 : Biologie computationnelle et modélisation des systèmes biologiques complexes.

Les connaissances et méthodes acquises dans ces axes contribuent à relever deux défis sociétaux majeurs : la transition agro-écologique des élevages et la mise en oeuvre du concept « One Health », ces derniers définissant deux axes plus opérationnels :

• Axe 3 : Systèmes d’élevage et alimentation saine et durable.
• Axe 4 : Interactions entre organismes, écosystèmes et environnement.